日本において、通関士（つうかんし、英語: Registered Customs Specialist）とは、通関業者が、通関業務を適正に行うために設置が義務付けられている者。輸出入されている物品の輸出入者が通関手続（税関への手続）を通関業者に依頼をした際に通関手続きの代理代行並びに税関への申請をする場合、通関業者は税関へ提出する書類を通関士に審査させることが必要である。通関士となるためには、通関士試験に合格する必要があり、この合格を財務省管轄の国家資格として扱われるが、厳密には通関士とは、通関士試験に合格の資格を持ち税関から通関士の確認を受けて勤務している者を指す。

通関士は貿易業界の税理士、行政書士のような役割がある。しかしながら他人の依頼により貨物の輸出入申告手続きを行うことができるのは、通関業者であって通関士は、通関業者が置かなければいけない資格職である。

通関士が税理士や公認会計士のように独立開業するのは限りなく不可能に近い。可能性があるとすれば個人で通関業者となるしかないがこれは非常に困難である。

通関士として勤務するには通関業の許可を受けた通関業者に勤務し、財務大臣による確認を受けることを要件とする。通関部門を自社に持つメーカー等の場合、自社の貨物の通関業務に通関士試験合格者を雇用しても、通関業者ではないため通関士の確認を受けることはできない。

商社や銀行（L/C発行銀行）に勤務する際には、就職する上でのアピールポイントになるが、通関士として勤務することはない。しかし、貿易業界での唯一の国家資格ということから、資格を取得だけして勤務している人は多々いる。

学歴、年齢、経歴、国籍等についての制限がなく、誰でも試験を受けることができる。

例年7月1日に通関士試験の公告が官報で行われ、税関ホームページにも通関士試験の公告が掲載される。8月上旬から8月中旬と申し込み可能期間が短いことに注意を要する。申込方法には直接足を運び税関で書類申請する、申し込み書類を郵送で請求し返送する、NACCSによるネット申請をするというものがある。

以前は10月の中旬頃であったが、最近は10月の第一日曜日が多い。しかし2018年の第52回通関士試験は、第二日曜日の10月14日に実施された。第一日曜日が7日となる場合、翌日が体育の日（10月の第二月曜日、2020年以降はスポーツの日に改称）となり、三連休の中日を避けている可能性があるが、日時の決定について理由の公表はないので、推測しかできない。

試験は年1回（通関業法では年1回以上となっているが、年2回実施されたことはない）、10月上旬か中旬の日曜日（近年は当月第1日曜日に設定されることが多い）に全国13ヶ所（受験者の多いところでは大学を借りて行なうことが多い。また同一都市でも2箇所以上に分散することもある）で実施している。例えば、東京税関管轄の受験であれば、東京会場と新潟会場があり、前者は、近年、東京大学駒場キャンパスである。会場は毎年借りることになるため、年によって異なることがある。合格者の発表は同年の11月下旬に官報で受験番号と名前が公告される。またインターネット官報で合格発表日の8時30分過ぎに閲覧することができる。税関ホームページにて閲覧できるのは10時過ぎである。受験した税関の各官署にも合格者の受験番号が提示される。さらに合格者のみに受験した税関（本関業務部の通関業監督官）から合格証書が合格発表日に送付されることになっている。

2006年10月1日実施の第40回試験より回答形式が大幅に変更され、全問マークシート方式となった。 通関実務においては、携帯用電子計算機（携帯電話などの小型端末を除く）の持ち込みが指示されている。電卓の打音が気になる場合には耳栓の持ち込みも可能であるが、事前に試験監督官に申し出る必要がある。